Експерти з геноміки заявляють про відсутність доказів для більшої половини опублікованих генів, які викликають синдром подовженого інтервалу QT (LQTS) і регулярно оцінюються комерційними панелями генетичних тестів.
З 17 генів, раніше описаних в літературі, що сприяють LQTS, дев'ять були класифіковані як «спірні» для асоціації з хворобою.
Тільки три гена, вперше асоційовані з LQTS - KCNQ1, KCNH2 і SCN5A - мали «явні» докази в якості генетичної причини типових LQTS.
Чотири інших гена - CALM1, CALM2, CALM3 і TRDN - мали вагомі або переконливі докази того, що вони викликають рідкісні випадки LQTS у дітей і дітей з атиповими ознаками.
Ген CACNA1C мав певний зв'язок з рідкісним поліорганним станом, синдромом Тімоті, але мав підтвердження тільки помірного рівня для LQTS.
Науковці заявляють, що гени зі спірними або обмеженими доказами причин LQTS не слід регулярно тестувати в діагностичних цілях у пацієнтів з підозрою на LQTS. Тестування таких генів створює ризик невірного тлумачення генетичної інформації і, можливо, невірного діагнозу у пацієнта.
Багато з основоположних досліджень для шести спірних (AKAP9, ANK2, KCNE2, KCNJ5, SCN4B і SNTA1) і трьох генів з обмеженими доказами (CAV3, KCNE1 і KCNJ2), наприклад, були засновані на підході гена-кандидата, який з більшою ймовірністю дає хибнопозитивний результат, ніж дослідження загальногеномної асоціації.
Також були ідентифіковані варіанти, які поширені в певних популяціях, таких як варіант ANK2 p.Glu1458Gly, присутній приблизно у кожного з 650 чоловік європейського походження і у кожного з 400 чоловік латинського походження.
Докази, необхідні для визначення генетичного варіанту як патогенного, різко змінилися. Десять років тому було досить знайти один пробанд з рідкісним генетичним захворюванням, таким як LQTS, у якого був несинонімічний варіант, який змінював функцію логічного гена-кандидата in vitro.
В рамках дослідження вчені вивчили генетичні панелі LQTS з 36 лабораторій в Північній Америці, Європі та Австралії / Нової Зеландії і виявили, що гени, як і визначені як спірні або з обмеженими доказами для LQTS, регулярно тестувалися у 83-100% панелей тестів для LQTS. Тільки KCNQ1, KCNH2, SCN5A, KCNE1 і KCNE2 були виключені з комерційної панелі.
З огляду на те, що LQTS є найбільш поширеним спадковим синдромом аритмії, що виявляється приблизно одного з 2000 чоловік, рутинним генетичним тестуванням, результати дослідників матимуть важливі клінічні наслідки.
Літературні посилання знаходяться в редакції Webcardio.org